exonuclease 跟endonuclease 差在哪?

對這個觀念不清楚, 不知道是高中選修生物就有懂還是忘記,還是大一Campbell沒念...

youtube蒐尋找了個順眼的看,

分享影片筆記

影片連結: https://www.youtube.com/watch?v=YiMSjs6yOAA&t=992s

exonuclease 跟endonuclease 差在哪?

exonuclease 跟endonuclease 都是 cut phosphodiester bond

差別在

Endo 是 cut 序列中間的 phosphodiester bond

也可以cut 雙股的DNA

所以Endo 可以 cut 雙股的DNA序列中間的 phosphodiester bond

 

Exo則只能cut 單股的DNA序列

而且不能從中間cut, 只能從 端點 end 來 cut

所以Exo 只能 cut 單股的DNA序列端點end的 phosphodiester bond (PDE)

 

下面詳細介紹exonuclease 跟endonuclease

 

1.     endonuclease

endonuclease 又稱為restriction enzyme, 限制酶, 因為可以專一性 specific的切 phosphodiester bond (PDE)

Blunt end 是什麼?

這種直直切, 造成2個數量一樣的切點, 叫Blunt end

切點左邊, .有2個nucleotide,

切點右邊, .有2個nucleotide,

 

如果切點左邊跟右邊的nucleotide 數量不同, 例如 6 個, 切成一邊1個,另一邊5個, 就不是形成Blunt end, 而是形成 sticky end

因為切點左邊跟右邊的nucleotide 數量不同, 所以有一些nucleotide是沒有用氫鍵連接對面DNA的nucleotide, 所以會有黏性,可以黏別人

 

小結論: endonuclease可以造成 Blunt end或 sticky end

1.     exonuclease

因為只能從end端點開始切, (不能從中間切)

所以有2種exonuclease

  (1) 5’→3’ exonuclease, 從5’ (磷酸根)開始切

  (2) 3’→ 5’ exonuclease, 從3’ (磷酸根)開始切

21:58這個圖是講 5’→3’ exonuclease, 從5’ (磷酸根)開始切, 而且只切單股 (不像endo是切雙股)

那 3’→ 5’ exonuclease, 就是反過來, 從3’ (五碳糖的第3個碳)開始切

UW1476 有考xeroderma pigmentosum, 因為造成的DNA dimer是還是在雙股的DNA

雙股的DNA就需要endonuclease來切出一個nicke, 後續再補上修復DNA

不能選exonuclease, 因為exonuclease只能 切單股的DNA,不能切雙股的DNA, 而且只能從端點end切, 不像是 endonuclease可以從DNA序列的中間切

 

然後我覺得這裡UW的解釋根本不能讓底子不夠的人,連endonuclease跟exonuclease是什麼差在哪都不知道的人, 了解真正的道理

甚至會誤以為要死背xeroderma pigmentosum就是 endonuclease作用,

然後3'→5' exonuclease 是proofreading

如果用背的,而不是用想的知道背後道理,即使用anki背的再熟,應該會有永遠背不完的東西,考試又不一定是我背到的吧.... (補充anki背得得要是先理解過的東西,不能用anki背不理解的東西,事倍功半)

難怪百哥醫學路標系統會說, 要答對率>60%,才能夠開始進入全職UW,否則做完UW超過2000題,還是不能去考試的

但是我不認同那個路標系統說,補救方法是kaplan影片就是了,覺得對台灣醫學生不一定有用,懷疑有$因素?