Taiwan USMLE note

  SAD PUCKER - Retroperitoneal organs youtube 影片! https://www.youtube.com/watch?v=ZxS_Nhae6Js 那塊可以拿掉的也是 retroperitoneal

 1. 如何把UW 的 文字/ 圖片/ 表格複製下來?  不用截圖 可以直接用網頁版 (google chrome) 直接用滑鼠拉選文字/ 圖片/ 表格 直接拉到自己想要的地方 (例如word, ppt, anki中的某一欄) 這樣就可以完美複製UW 裡的所有文字了! (也可以貼到google翻譯, 這樣以後看中文是否會加速理解? not sure guys) 2.看英文網站如果想做筆記,但是不想一直切換視窗, 個人常用 ''記事本'' 記事本字超級小, 但是其實字體是可以放大的! 按control + 滑鼠滾輪 3.有些網站是可以用email試用 可參考 https://www.ewdna.com/2011/10/10-min-email.html?fbclid=IwAR20AJavee7RMi4CecCq8KS6-nvVie465WS9WOxSi-WAlFYrekss9XsCDpU 就有很多email (如果要keep固定一個email: https://temp-mail.org/) 4.NBME免費簡答網站 (感謝網友告知) NBME 解答破解版:(感謝網友告知) https://www.publishthis.email/nbme-answers-ryfA2Ho_P scramble看不到字,所以有破解的網站,請低調服用 破解方法: 聽說是在原網址前面, 加上free, 就變成免費 例如NBME 24 https://freenbme.com/exam/nbme24.html?fbclid=IwAR1lx92739nWEMveGR37mbCfrWPfpCBgTTXs3GSZmeB-YTEdDd4mNjtzp0Y 想看其他份,可以改成其他數字 Free 120 https://freenbme.com/exam/ free120.html?fbclid= IwAR1lx92739nWEMveGR37mbCfrWPf pCBgTTXs3GSZmeB- YTEdDd4mNjtzp0Y NBME  24 https://freenbme.com/exam/ nbme24.html?fbclid= IwAR1lx92739nWEMveGR37mbCfrWPf pCBgTTXs3GSZmeB- YTEdDd4mNjtzp0Y NBME

這個ELISA聽說step 1 會結合其他觀念考, 所以一定要很清楚  簡單講就是測到底檢體(例如體液/血液)裡面有沒有特定的antigen或antibody, 測的方法分成direct ELISA, indirect ELISA, Sandwich test 1.direct ELISA (1)先加入病人檢體, 假如病人檢體裡面有antigen, 就會黏在plate上 (其他沒有antigen的地方, 也有放blocking物質預防跟後續東西結合,避免不必要亂結合→偽陽性) (2)加入antibody (enzyme linked antibody) 如果要看到 antigen A, 就需要antibody A 先去跟他結合, 才看得到 然後antibody上面有link一個enzyme, 之後就能偵測這個enzyme, 進而偵測到antibody,代表有antigen 那這個antibody就叫做enzyme linked antibody 那我們是怎麼偵測這個enzyme有作用的呢?  是看enzyme有沒有作用 所以會在溶液中加入 colorless substrate, 如果enzyme有作用, 就可以把colorless substrate變成 colorful product 假如有變色, 代表enzyme有作用, 而偵測到antibody,代表有antigen (3)下一步是wash, 把沒有 bind在antigen的antibody (unbound antibody)wash掉 所以只剩下 有bind 在antigen B的antibody B, 留在plate (4)加入 colorless substrate 那我們antibody B (已經結合在antigen B上), 就可以把colorless substrate變成 colorful product 假如有變色, 代表enzyme有作用, 有antibody跟antigen存在 2.indirect ELISA (1)先加入病人檢體, 假如病人檢體裡面有antigen, 就會黏在plate上 (其他沒有antigen的地方, 也有放blocking物質預防跟後續東西結合,避免不必要亂結合→偽陽性) (2) 再加入 primary antibody ( 沒有 enzyme link

  覺得應該先把基礎病理學讀好,再讀區域病理學 基礎病理學就是FA 寫pathology的部分 (pathoma 1-3 chapters) 區域病理學就是FA後面分器官系統之後, 寫pathology的部分 舉個例子 如果沒有先了解 基礎病理學中腫瘤學, carcinoma in situ未穿過basement membrane, 假如 穿過了basement membrane就變成invasive carcinoma 那先讀breast pathology,  看到書上說DCIS可能變成invasive carcinoma LCIS不會變成invasive carcinoma 那就無法了解這句話背後的意思 DCIS可能穿過basement membrane LCIS不會穿過basement membrane 流於死背 至於如何把基礎病理學讀好, 看個人 有人已經有讀書籍的基礎, 看pathoma 1-3 chapters就能懂 假如是visual learner看osmosis可能有幫助 自己要如何讀書/架構/筆記,讓知識進入自己的大腦,這點每個人大腦不同需要自己摸索

 FA上的每一個字都要讀通,才能去考Step 1 讀通FA上的一個字, 需要花多少時間,精力理解多少內容,看多少影片/書籍? (正因為UW是連結FA的各個知識點, 所以假如還沒有把FA的個別知識點讀通, 就做UW,很容易流於死背, 效果打折) FA2018 p. 660寫 pancreatitis 可能造成ARDS 為什麼?  FA291 pancreatitis: pancreatic enzyme autodigestion, 所以necrosis (liquefactive或fat necrosis, FA209), necrosis會造成acute inflammation (FA212), 然後在地的macrophage會分泌IL-1, IL-6, TNF-alpha吸引neutrophil過來 (透過FA213的機制,margination, 停車, 穿越內皮,進到組織,在chemotactic: C5a, IL-8, LTB4吸引下前往事發地點), 然後活化的neutrophil分泌protease或 ROS造成細胞injury/damage→ vessel的endothelial也變leaky (inflammation的機制)→protein rich fluid進入alveoli (算exudate?), 這些東東在alveolu形成一層hyaline透明物質, 阻擋氣體交換diffusion→V/Q mismatch (有perfusion, 但是無法ventilation)→ARDS: 喘, 心臟沒有問題, 純粹肺臟問題

假設有個人不知道meninge就是 dura mater, arachnoid, pia mater 然後影響這三者之間，可能造成inflammation of meningie 然後他就開始狂做Uw題目 假設有一題UW題幹給 When the patient's hip is flexed, she is unable to fully extend her knee because of pain.   好他認出Kernig's sign的PE finding 然後答案是meningitis 他就以為然後死背Kernig sign: painful passive extension of the knee when the thigh is flexed at the hip=  meningeal irritation 還做成anki死背 每天背,每天複習 painful passive extension of the knee when the thigh is flexed at the hip=  meningeal irritation painful passive extension of the knee when the thigh is flexed at the hip=  meningeal irritation painful passive extension of the knee when the thigh is flexed at the hip=  meningeal irritation 但是他並沒有真正的懂，他並沒有疑問, meninge是什麼? 在解剖圖長怎樣? 所以下次題目又給同樣Kernig's sign的PE finding, 但答案沒有meningitis 他就選不出來另外一題的答案是SAH 因為他不知道 meninge就是 dura mater, arachnoid, pia mater SAH也會irritatie meninge 因為他只是死背答案，以為檢討UW題目就是在學習 但是Uw的詳解是救不了底子，所以要真正先讀書看影片，整理筆記，先把底子弄好，才能開始大量做題 沒有先把底子打好，就開UW來做的下場就是，做完UW2000-3000題，還是沒辦法去考試，因為根本沒有底子，解

 elastin彈性蛋白合成(跟collagen平輩的一種蛋白,collagen組成collagen fiber, elastin組成elastic fiber)(不重要, 有些內容不確定,只是寫大概因為FA跟AMBOSS也沒寫,重點是疾病關聯性) 參考資料: osmosis, FA52 0. elastin是一種secretory protein, 由RER製造之後,出去細胞膜, 再去該去的tissue (例如去lung或血管) 1. 基因轉錄, 轉譯成amino acid 在細胞核裡面,基因 轉錄成RNA, 出細胞核,到細胞質結合free ribosome,然後 ribosome會做出一條signal peptide (還沒開始做mRNA要做出來的peptide), 有signal peptide之後, 整個mRNA-ribosome complex就可以跟細胞質裡面的signal recognition particle (SRP)結合, 然後結合了SRP的SRP receptor, 會bind並水解一個GTP成GDP, 這樣就有能量,然後SRP-ribosome complex就可以結合translocon, 之後可以把 ribosome製造的peptide送進ER 完成任務的SRP receptor就會release, 回收再利用 所以現在ribosome已經結合在ER的 translocon上, 所以Ribosome製造的所有 peptide都會直接進 ER membrane 然後mRNA轉譯完的peptide, 會把之前的SRP(signal sequence)cleaved 掉 然後translocon關閉, peptide維持在 ER裡面  這一條peptide就叫proelastin (?) 這條elastin基因轉錄轉譯出來的peptide裡面也是有glycine, proline跟lysine, 跟collagen成分類似, 差別在於collagen會有hydrolation把proline跟lysine加上-OH 羥基 hydroxy group  但是elastin不會 hydrolation (所以elastin不用進行hydrolation跟glycosylation,也不用形成triple helix(?) 2.從RER送到Golg

collagen synthesis 膠原蛋白合成 FA50, 結合FA47cell trafficking觀念  參考資料: osmosis影片, FA, AMBOSS 0. collagen是一種secretory protein, 由RER製造之後,出去細胞膜, 再去該去的tissue (例如type 2 collagen就該去cartilage) 1. 基因轉錄, 轉譯成amino acid 在細胞核裡面,基因: COL開頭, 轉錄成RNA, 出細胞核,到細胞質結合free ribosome,然後 ribosome會做出一條signal peptide (還沒開始做mRNA要做出來的peptide), 有signal peptide之後, 整個mRNA-ribosome complex就可以跟細胞質裡面的signal recognition particle (SRP)結合, 然後結合了SRP的SRP receptor, 會bind並水解一個GTP成GDP, 這樣就有能量,然後SRP-ribosome complex就可以結合translocon, 之後可以把 ribosome製造的peptide送進ER 完成任務的SRP receptor就會release, 回收再利用 所以現在ribosome已經結合在ER的 translocon上, 所以Ribosome製造的所有 peptide都會直接進 ER membrane 然後mRNA轉譯完的peptide, 會把之前的SRP(signal sequence)cleaved 掉 然後translocon關閉, peptide維持在 ER裡面  這條collagen基因轉錄轉譯出來的peptide裡面一定有glycine, 另外2個不一定, 大多是 proline跟lysine 這一條peptide就叫preprocollagen 這個時候還在RER裡面. 簡單修飾: hydrolation跟glycosylation醣基化 2.這一條preprocollagen進行 hydroxylation 因為preprocollagen上面有 proline跟lysine, 所以preprocollagen上的proline跟lysine會進行hydroxylation 把preprocollagen上的proline跟

apoptosis extrinsic pathway Fas ligand的詳細機制: extrinsic pathway就是別人分泌物質,引導細胞自殺 當巡邏的 macrophage 看到一個細胞是old cell, 或pathogenic cell (有病),或已經完成任務,可以死了 macrophage會啟動extrinsic pathway: 分泌 TNF-α TNF-α會bind 在target cell (該死的細胞)上面的death receptors (是一種TNF receptor, Fas跟TNF-1 receptor都是屬於TNF receptor family, 可以接收TNF的) death receptor是穿膜蛋白, transmembrane receptor, 所以有一部分在細胞外, 有一部分在細胞內 death receptor在細胞內 (cytosolic)的部分, 叫  death domain. 當TNF-α bind to TNF-1 receptor (或是Fas ligand receptor), death domain 改變構型, 然後可以bind 另外2個protein:  1. FADD (Fas-associated protein with death domain)   2. TRADD (Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein) (UW298的圖只有畫FADD) 然後這兩個蛋白會聚起來形成一個complex (名字不重要),這個complex可以活化caspase 8跟10 (把pro-caspase切成caspase) 然後caspase (cytosolic protease)就可以開始執行apoptosis caspase可以切cell’s nucleus, organelles, and cytoskeleton 切cytoskeleton,沒有骨架→cell blebbing, bleb很weak所以 會從cell membrane脫落, macrophage過來吃掉細胞fragment (extrinsic pathway有2種路徑, 1.靠ligand receptor 2.靠immune

 FA2018. p.208 apoptosis這邊有一行: DNA laddering (fragments in multiples of 180 bp) is a sensitive indicator of apoptosis 這句話是什麼意思?! 看FA看不懂, 來查youtube關鍵字: DNA laddering apoptosis 好像沒有特別有名品牌channel的影片, 看點閱率跟呈現方式, 先選了這個 然後看這個影片跟大家分享筆記 https://www.youtube.com/watch?v=dVSVO39-Ok8 請搭配影片服用~ Apoptosis 其實蠻多 assay 的 先介紹 DNA fragmentation assay ( 應該就是 FA 上的 ) 牽涉到一個 enzyme 叫 DNase, 通常 DNase 不會作用 , 因為被 ICAD bind 著 假設現在有 ICAD inhibitor, 把 ICAD 除掉 , 那就讓 DNase 自由了 , 可以作用 DNase 的作用是什麼 ? cleave DNA, 會把 DNA 切成一段一段的 , 基本上是每一段 200bp (FA 寫 180) 但是因為 DNase 是 randome 切 , 所以不一定連續切 , 所以可能會空一些片段 , 然後後面繼續切 200 bp ( 以前生化好像有教過 ?) 反正結論是切出來的 fragment, 有些 200 bp.  有些 400 bp. 有些 600 bp., 理論上 是 200 的倍數(?) 下面介紹另一個 assay: DAPI stain (DAPI 是一種化合物 , 全名 : DAPI [4,6-Diamidino-2-phenylindole, dihydrochloride]) DAPI 會發出一個波長的光 , 然後會 bind DNA, 所以我們可以根據 DAPI 發出的光 , 來推論 DNA 的狀況 , 是完整還是被片段化 (fragmented, 如果有 apoptosis 進行 ) 有光就有數據 , 這個 assay 可以定量   DAPI 下只會看到 nuclei ( 內有 DNA) 細胞膜是看不到的 , 沒 stain ( 雖然其實存在 , 完整 ) 沒有 apo

  lymphoma/leukemia translocation genetics MEMORIZED WITH 1 EASY TRICK 影片網址: https://www.youtube.com/watch?v=A_eLJqq0Hcg https://www.youtube.com/watch?v=BhDQMwMVSpE 有chromosome 14是lymphoma,  chromosome 14上面是製造Ig heavy chain的基因

  UW1568 A酸 acne 痘痘 retinoid  isotretinoin retinol retinal retinoic acid (RA) FA. 66, 善用FA 電子檔 搜尋功能, 一次過把相關的讀通 搞不好有人自己在用A酸XD retinol是外用A酸藥膏 (vit A衍生物),進入epidermal表皮層細胞(suprbasal keratinocyte),被轉換成retinal, 然後再轉換成Retinoic acid (RA),這是生物活化態(biologically active) 在細胞質裡面的一個蛋白 CRABP (retinoic acid binding protein), 看到有Retinoic acid(RA)出現在細胞質了, 會把Retinoic acid(RA)送進細胞核裡面,參與DNA transcription調控 細節如何調控呢? 進入細胞核的Retinoic acid(RA)會bind receptor, 不是RXR (retinoid X receptor), 就是RAR (Retinoic acid receptor) 然後bind了RA的 RXR或RAR, 就會去bind DNA的retinoic acid response element片段(RARE), 增加合成transcription facor, 可以增加合成一些GF (growth factor), 所以促進basal keratinocyte增生,讓epiderma differentiation (keratinization)正常化, 把死細胞往外推, 不會讓已經角質化的細胞一直堆在那,促進cell turnover, 也讓皮脂腺 sebaceous glands製造的sebum變少→痘痘少 參考影片: https://www.youtube.com/watch?v=zxWh-7IC7HY https://www.youtube.com/watch?v=FtV22XP7q2A A酸的成分叫, 除了治療青春痘, 也可以治療measles 也可以治療 acute promyelocytic leukemia (APL), 因為APL 是t(15:17), 然後RAR (Retinoic acid receptor)在chromosome 17

 matrix metalloproteinases (包含 collagenases)大整理: wound healing 的最後階段scar foramtion, 要分解過多的collagen 所以 macrophage/neutrophil會釋放 matrix metalloproteinases (包含 collagenases),來分解type 3 collagen, 之後主要變type 1 collagen, 所以collagenases (需要zinc 協助)負責Tissue remodeling 另外, 當tumor要invade basal membrane, 從CIS (carcinoma in situ)變成 invasive cancer, 要突破basement membrane, 也是用matrix metalloproteinases (包含 collagenases, hydroxylase),來分解basement membrane (跟ECM) 補充collagenase Dysregulation of collagenase→destruction of the extracellular matrix (ECM) (e.g., in gas gangrene).  可以用來治療Dupuytren contracture (手掌腱膜攣縮症),讓Tissue remodeling 可以用來治療 Peyronie disease(陰莖彎曲), 讓Tissue remodeling collagenase也已用來promote wound healing. 另外,Osteoclast破骨細胞如何破骨? 分泌H+ and collagenases

對這個觀念不清楚, 不知道是高中選修生物就有懂還是忘記,還是大一Campbell沒念... youtube蒐尋找了個順眼的看, 分享影片筆記 影片連結: https://www.youtube.com/watch?v=YiMSjs6yOAA&t=992s exonuclease 跟 endonuclease 差在哪? exonuclease 跟 endonuclease 都是 cut phosphodiester bond 差別在 Endo 是 cut 序列中間的 phosphodiester bond 也可以 cut 雙股的 DNA 所以 Endo 可以 cut 雙股 的 DNA 序列 中間 的 phosphodiester bond   Exo 則只能 cut 單股的 DNA 序列 而且不能從中間 cut, 只能從 端點 end 來 cut 所以 Exo 只能 cut 單股 的 DNA 序列 端點 end 的 phosphodiester bond (PDE)   下面詳細介紹 exonuclease 跟 endonuclease   1.      endonuclease endonuclease 又稱為 restriction enzyme, 限制酶 , 因為可以專一性 specific 的切 phosphodiester bond (PDE) Blunt end 是什麼 ? 這種直直切 , 造成 2 個數量一樣的切點 , 叫 Blunt end 切點左邊 , . 有 2 個 nucleotide, 切點右邊 , . 有 2 個 nucleotide,   如果切點左邊跟右邊的 nucleotide 數量不同 , 例如 6 個 , 切成一邊 1 個 , 另一邊 5 個 , 就不是形成 Blunt end, 而是形成 sticky end 因為切點左邊跟右邊的 nucleotide 數量不同 , 所以有一些 nucleotide 是沒有用氫鍵連接對面 DNA 的 nucleotide, 所以會有黏性 , 可以黏別人   小結論 : endonuclease 可以造成 Blunt end 或 sticky end 1.      e